10/2009: Matías Cubero ist U-15 Nationalspieler für Uruguay.

11/2009: Matías Cubero nimmt für Uruguay an der Sudamericano Sub-15 2009 (U-15 Südamerikameisterschaft) in Bolivien teil.

11/2010: Matías Cubero ist U-17 Nationalspieler für Uruguay.

03/2011: Matías Cubero nimmt für Uruguay an der Sub 17 Sudamericano 2011 (U-17 Südamerika-Meisterschaft) in Ecuador teil. 

06/2011: Matías Cubero nimmt für Uruguay an der U-17 Weltmeisterschaft 2011 (FIFA Under 17 World Cup 2011) in Mexiko teil und wird am 10. Juli WM-Zweiter mit einem 0:2 gegen Weltmeister Mexiko.

2012: Matías Cubero ist U-20 Nationalspieler für Uruguay (Uruguay national under 20 football team).

01/2013: Matías Cubero nimmt für Uruguay an der U20 Südamerikameisterschaft in Argentinien teil (Campeonato Sudamericano Sub-20 de 2013).

06/2013: Matías Cubero nimmt für Uruguay an der FIFA U 20-Weltmeischaft (FIFA World Cup Under 20) in der Türkei teil.