20.07.06: John Jairo Mosquera ist Juniorennationalspieler für Kolumbien, nahm an der Sudamerican Sub 16 in Paraguay teil.Der Mittelstürmer debutierte mit 14 Jahren in der ersten kolumbianischen Liga.

02.09.06: Der kolumbianische Juniorennationalspieler John Jairo Mosquera wechselt für die Saison 2006/2007 auf Leihbasis zu Wacker Burghausen.

01.06.07: John Jairo Mosquera kehrt nach Ablauf der Leihe von Wacker Burghausen zu Werder Bremen zurück.

01.08: John Jairo Mosquera wird von Werder Bremen an A. Aachen verliehen. 

06/08: John Jairo Mosquera wird von Werder Bremen an HFK Sönderjyske verliehen.

27.07.09: Nachdem John Jairo Mosquera seinen Vertrag bei Werder Bremen vorzeitig um zwei Jahre bis zum 30.06.2012 verlängert hat, wechselt der 21-jährige kolumbianische Mittelstürmer für zwei Jahre auf Leihbasis zu Union Berlin. Sollten die Berliner nach einer Saison aus der 2.Bundesliga absteigen, endet der Leihvertrag nach nur einem Jahr.